大陸委員會
行政院本部
人事行政總處
主計總處
環境保護署
海岸巡防署
大陸委員會
農業委員會
公共工程委員會
原子能委員會
二級主管機關（部）
內政部
外交部
國防部
財政部
教育部
法務部
經濟部
交通部
衛生福利部
文化部
勞動部
科技部
二級主管機關（會）
蒙藏委員會
僑務委員會
客家委員會
金融監督管理委員會
國家發展委員會
國軍退除役官兵輔導委員會
原住民族委員會
獨立機關
中央選舉委員會
公平交易委員會
國家通訊傳播委員會
其他
中央銀行
國立故宮博物院
- 人事行政總處
- 主計總處
- 環境保護署
- 海岸巡防署
- 大陸委員會
- 農業委員會
- 公共工程委員會
- 原子能委員會
- 公務人力發展中心
- 地方行政研習中心
- 海洋巡防總局
- 海岸巡防總局
- 香港事務局
- 澳門事務處
- 農糧署
- 漁業署
- 動植物防疫檢疫局
- 農業金融局
- 林務局
- 水土保持局
- 放射性物料管理局
- 內政部
- 外交部
- 國防部
- 財政部
- 教育部
- 法務部
- 經濟部
- 交通部
- 衛生福利部
- 文化部
- 勞動部
- 科技部
- 營建署
- 警政署
- 消防署
- 役政署
- 移民署
- 領事事務局
- 政治作戰局
- 軍備局
- 主計局
- 軍醫局
- 參謀本部
- 陸軍司令部
- 海軍司令部
- 空軍司令部
- 後備指揮部
- 憲兵指揮部
- 國庫署
- 賦稅署
- 關務署
- 國有財產署
- 臺北國稅局
- 高雄國稅局
- 北區國稅局
- 中區國稅局
- 南區國稅局
- 財政資訊中心
- 國民及學前教育署
- 體育署
- 青年發展署
- 廉政署
- 矯正署
- 行政執行署
- 調查局
- 最高法院檢察署
- 臺灣高等法院檢察署
- 工業局
- 國際貿易局
- 標準檢驗局
- 智慧財產局
- 能源局
- 礦務局
- 水利署
- 中小企業處
- 加工出口區管理處
- 民用航空局
- 中央氣象局
- 觀光局
- 公路總局
- 臺灣區國道高速公路局
- 航港局
- 疾病管制署
- 食品藥物管理署
- 中央健康保險署
- 國民健康署
- 社會及家庭署
- 文化資產局
- 影視及流行音樂產業局
- 勞工保險局
- 勞動力發展署
- 職業安全衛生署
- 勞動基金運用局
- 勞動及職業安全衛生研究所
- 新竹科學工業園區管理局
- 中部科學工業園區管理局
- 南部科學工業園區管理局
- 蒙藏委員會
- 僑務委員會
- 客家委員會
- 金融監督管理委員會
- 國家發展委員會
- 國軍退除役官兵輔導委員會
- 原住民族委員會
- 銀行局
- 證券期貨局
- 保險局
- 檢查局
- 檔案管理局
- 文化園區管理局
- 中央選舉委員會
- 公平交易委員會
- 國家通訊傳播委員會
- 中央銀行
- 國立故宮博物院